PCR

Moleculaire identificatie in de groep van ‘zwarte Aspergilli’: producenten van gevaarlijke toxines of niet?

Toegekend aan

- vaartland
Algemene info
Voor de identificatie van schimmels en gisten, afgezonderd uit de omgeving of van patiënten is zowel een morfologische karakterisering als een moleculaire identificatie noodzakelijk. Voor deze moleculaire identificatie extraheren we genomisch DNA en amplifiëren we verschillende genomische regio’s met behulp van PCR. Deze PCR producten worden dan gesequeneerd. Met deze sequenties gebeurt dan ook een fylogenetische analyse die inzicht verstrekt in de taxonomie van schimmels en gisten.



Omschrijving

Hoewel niet altijd zichtbaar, zijn schimmels en gisten alom vertegenwoordigd in onze leefomgeving. Veel schimmels worden in de keuken gebruikt, vinden toepassingen in de biotechnologie (fermentatie, productie van kazen) of worden gebruikt als bosverbeteraars.
Sommige kunnen echter een negatieve invloed hebben op onze gezondheid. De sporen van bepaalde schimmels zoals Alternaria en Cladosporium  zijn ernstige allergieverwekkers. Andere schimmels kunnen oppervlakkige of diepe mycoses veroorzaken bij de mens. Nog andere schimmels produceren toxines.

Labotechnieken voor de studie van bacteriën

Toegekend aan

- The A team  - labo bezoek op: 29/01/2010- Ervaringen
Algemene info
Binnen het Centrum voor Microbiële en Plantengenetica (CMPG) wordt fundamenteel genetisch onderzoek uitgevoerd met toepassingen in de landbouw en in de gezondheidszorg. De labodag zal zich afspelen in de groep voor Symbiotische en Pathogene Interacties (SPI). In deze groep onderzoekt men mechanismen die een rol spelen bij de overleving van de bodembacterie Rhizobium etli in de boonplant en bestudeert men de stressbestendigheid van de menselijke ziektekiem Pseudomonas aeruginosa.



Omschrijving

Deze bacterie is één van de meest voorkomende ziekenhuisbacteriën en kan ernstige infecties veroorzaken, voornamelijk bij personen die aan de erfelijke aandoening mucoviscidose lijden. Tijdens de labodag zullen de studenten kennismaken met de basistechnieken die nodig zijn om de pathogeen P. aeruginosa te bestuderen.

Hoe veilig is ons water?

Toegekend aan

- De wetenschappers - labo bezoek op: 14/01/2010
- De bronnetjes
Algemene info
Heel wat micro-organismen voelen zich thuis in een waterige omgeving. Het aantal en de soort micro-organismen die men aantreft is afhankelijk van de aard van het waterige milieu (zee-, rivier-, afval-, drinkwater). In huishoudelijk afvalwater kunnen pathogene bacteriën voorkomen en verschillende types van afvalwaterbehandeling werden ontwikkeld voor de zuivering van het water. Na de zuiveringsstappen moet het behandelde water nog gedesinfecteerd worden voor een veilig hergebruik. Omdat drinkwater levensnoodzakelijk is, is het ook één van de meest gecontroleerde levensmiddelen.



Omschrijving

Het onderzoek richt zich vooral op de chemische desinfectie met behulp van oxidatiemiddelen zoals chloor en chloorverbindingen. Door de oxidatie worden het microbiële celmembraan en/of de essentiële enzymen vernietigd waardoor de micro-organismen afsterven en worden schadelijke stoffen afgebroken. Zowel de werking van de chemische processen met onder andere de vorming van desinfectie bijproducten zoals trihalomethanen als de reductie van micro-organismen worden bestudeerd voor verschillende systemen.

HIV-LAB: detectie van en strijd tegen gevaarlijke micro-organismen !

Toegekend aan

- 6BIO - labo bezoek op: 19/01/2010- Ervaringen
- the acids - labo bezoek op: 02/02/2010- Ervaringen
Algemene info
Alleen scholen uit Oost- en West-Vlaanderen. Geschikt voor leerlingen uit het ASO of TSO vanaf de 3de graad en sluit aan bij verschillende onderwerpen uit de leerplannen biologie/natuurwetenschappen. In deze module zullen de leerlingen meer horen over de ziekte AIDS en het HIV-virus. We gaan dieper in op de bouw van virussen in het algemeen en de bouw van een HIV-virus. Verder komen onderwerpen als vermenigvuldiging van een HIV-virus, het ziekteverloop bij een besmette persoon, geneesmiddelen tegen AIDS, en de zoektocht naar een AIDS-vaccin aan bod.



Omschrijving

Begrippen die aan bod komen zijn: DNA, gen, genexpressie, afweersysteem, PCR, agarose, gelelektroforese, bloedcellen: microscopische analyse en in vitro kweek, HIV-sneltest.

Voorkennis
De leerlingen moeten reeds gehoord hebben over basisbegrippen; bloed, cellen, erfelijk materiaal. Een boekje met informatie zal worden opgestuurd naar de leerkracht voor aanvang van de sessie.

Micro-organismen en biodiversiteit

Toegekend aan

- 5bio - labo bezoek op: 12/02/2010
Algemene info
Alleen voor scholen uit Oost- en West-Vlaanderen. Geschikt voor leerlingen van het ASO en TSO vanaf de 3de graad. In deze module zullen leerlingen meer horen over het voorkomen van bacterien (oa in Antarctische wateren) en het karakteriseren dmv DNA technieken (PCR).



Omschrijving

Begrippen die oa aan bod zullen komen: DNA, eigenschappen, enzymen, DNA synthese, extremofielen, microscopie, voedingsbodems, zouttolerantie, ...

Voorkennis
De leerlingen moeten reeds gehoord hebben over basisbegrippen erfelijk materiaal en enzymen. Een boekje met informatie zal worden opgestuurd naar de leerkracht voor aanvang van de sessie.

Wat kan het gedrag van vliegen ons over onze eigen hersenen leren?

Toegekend aan

- cohe2 - labo bezoek op: 10/02/2010
Algemene info
In ons labo willen we inzicht krijgen in de genetische basis van gedrag. Gedrag wordt gecontroleerd door neuronale circuits in de hersenen. De ontwikkeling van de hersenen op hun beurt wordt bepaald door genen. Wij maken gebruik van de fruitvlieg Drosophila melanogaster om meer te weten te komen over deze genen.



Omschrijving

De fruitvlieg is een ideaal systeem om genetica te bestuderen: de vlieg is klein en gemakkelijk te kweken, het genoom is volledig gekend, en er zijn handige genetische “tools” voor ontwikkeld die toelaten om genfuncties te bestuderen. De homologie van genen en hun functie is ook eerder hoog tussen de vlieg en de mens. Zo is bijvoorbeeld ongeveer 75% van de genen die geassocieerd zijn met menselijke ziekten geconserveerd in de vlieg. Daarvan maken wij gebruik om genen te zoeken die een rol spelen in gedrag zoals agressie, learning & memory, en paargedrag.

Een nieuw griepvaccin, hoe kom je erbij?

Toegekend aan

- de apo's - labo bezoek op: 26/11/2009
Algemene info
Het griep- of influenzavirus infecteert jaarlijks tot tien procent van de wereldbevolking. In de meeste gevallen blijven de symptomen beperkt tot koorts, spier- en keelpijn en moet men een paar dagen het bed houden. Voor bejaarde mensen, hartpatiënten en mensen met verminderde immuniteit is griep levensbedreigend. Toch herstellen de meeste mensen van griep doordat het immuunsysteem het uiteindelijk haalt van het virus. Die immuniteit blijft levenslang bewaard.



Omschrijving

Waarom keert het virus dan telkens terug? Hoe wordt een griepvaccin gemaakt? Waarom is vaccinatie tegen griep elk jaar opnieuw nodig? De bedoeling van dit project is om niet alleen antwoorden te geven op deze vragen maar ook om te begrijpen hoe men door proeven in het laboratorium tot deze antwoorden is gekomen.

Resistente ratjes

Toegekend aan

- de andreetjes
- 6wis uit KAN - labo bezoek op: 25/01/2010
- gotcha! - labo bezoek op: 29/01/2010- Ervaringen
Algemene info
Tijdens de labodag zullen we DNA extraheren uit weefsel van ratten en een PCR reactie uitvoeren van het gen dat verantwoordelijk is voor de resistentie. Aan de hand van sequentieanalyse die zal worden gedemonstreerd, kan bepaald worden of een rat al dan niet een gemuteerd gen draagt. De vraag aan jullie is om uit te maken of de onderzochte ratten resistent zijn of niet. Daarnaast zullen we ook bloedstollingtesten uitvoeren. Deze testen tonen eveneens aan of een dier al dan niet resistent is.



Omschrijving

De bruine rat is een pestsoort die bestreden dient te worden. Ze zien er misschien wel lief uit, maar ze veroorzaken veel schade en kunnen ziektes overbrengen. Overal in de wereld en ook in Vlaanderen, vangen en doden natuurwachters ratten zodat de aangerichte schade beperkt blijft. De bestrijdingsmiddelen die daarbij worden gebruikt, zijn niet steeds doeltreffend omdat de diertjes er ongevoelig (resistent) voor worden. Deze resistentie is te wijten aan mutaties in een specifiek gen.

Heb ik nu slaapziekte, ja of nee?

Toegekend aan

- talige wetenschappers - labo bezoek op: 02/03/2010
Algemene info
Slaapziekte of humane Afrikaanse trypanosomiase is een infectieziekte overgebracht door tseetseevliegen. De parasiet is een ééncellige die zich vermenigvuldigt in het bloed en de lymfe van de patiënt maar uiteindelijk ook de hersenen bereikt. De ziekte is dodelijk maar kan behandeld worden. De medicamenten zijn echter zeer giftig en daarom is een juiste diagnose erg belangrijk voor de patiënt.



Omschrijving

Symptomen van hersenaantasting zoals slaapstoornissen en abnormaal gedrag zijn kenmerkend bij patiënten in een vergevorderd stadium. Het is beter een diagnose te kunnen stellen in een vroeger stadium, bv. de aanwezigheid van de parasiet (bv. in bloed). In vele gevallen lukt dit niet omdat er gewoon te weinig parasieten in het bloed aanwezig zijn. Aantonen van antistoffen kan dienen als surrogaattest. Modernere tests zijn gebaseerd op het aantonen van het genetisch materiaal van de parasiet (DNA via PCR of RNA via RT-PCR).

Waarom verschillen bladeren van vorm en grootte en hoe kunnen we bladgroei bevorderen?

Toegekend aan

- OLVH - labo bezoek op: 23/02/2010- Ervaringen
Algemene info
Planten en plantaardige producten zijn onontbeerlijk voor de mens, zowel als voedselgewas, als in de vorm van voedergewas. Verwacht wordt dat de komende decennia de wereldbevolking zal toenemen met ongeveer 3 miljard mensen, die allen gevoed moeten worden.



Omschrijving

Daarnaast zijn planten de laatste jaren een bijkomende rol gaan vervullen, nl. die van biomassa voor de productie van bio-energie. Bio-energie is per definitie energie die opgewekt wordt, door bijvoorbeeld verbranding, uit alle plantaardig materiaal. Hierbij denken we aan o.a. snoeiafval, gft, mest, maar ook aan gewassen die speciaal geteeld worden voor energiedoeleinden, zoals suikerriet, populieren en koolzaad.

Inhoud syndiceren

 

 

Laatste nieuws

01.02.10Post nu je ervaring en win een iPOD!
Schrijf, zing, teken of film een verslag van jouw labodag, post het op ...
26.08.09Meerdere teams inschrijven?
Wanneer je meerdere teams wil inschrijven, dien je voor elk team een a ...
26.08.09Verhoog je kans!
Selecteer een project in het VIB-LAB (project) als één van je vier v ...
Alle nieuwtjes